Sağlık hukukundan doğan uyuşmazlıklar yargı yolu itibarıyla da özelliklidir. Özel hastane hasta, serbest çalışan hekim-hasta, özel hastanede çalışan sağlık çalışanı-hasta arasındaki bir hukuki uyuşmazlık nedeniyle açılan davalar adli yargı yoluna tabi iken kamu hastaneleri söz konusu olduğunda husumet Sağlık Bakanlığına yöneltilecek ve idari yargı yoluna tabi olacaktır. Bilindiği gibi tam yargı davaları arabuluculuk kapsamı dışındadır. Ancak, Hukuk Uyuşmazlıklarında Arabuluculuk Kanunu ve Hukuk Uyuşmazlıklarında Arabuluculuk Kanunu Yönetmeliği ile idarenin taraf olduğu özel hukuk uyuşmazlıkları da arabuluculuk kapsamına alınmıştır. Hastanın bir kamu hastanesinde zarar görmesiyle neticelenen tıbbi müdahalede, zararı tazmin eden Sağlık Bakanlığının bu zarara sebep olan hekim veya sağlık çalışanları aleyhine açacağı rücu davaları, asliye hukuk mahkemesinde açıldığından bu uyuşmazlık, arabuluculuğa uygun olup ihtiyari arabuluculuk kapsamındadır.